1． 配置系統管理（Admin Web Application）
大多數商業化的J2EE服務器都提供一個功能強大的管理界面，且大都采用易于理解的Web應用界面。Tomcat按照自己的方式，同樣提供一個成熟的管理工具，并且絲毫不遜于那些商業化的競爭對手。Tomcat的Admin Web Application最初在4.1版本時出現，當時的功能包括管理context、data source、user和group等。當然也可以管理像初始化參數，user、group、role的多種數據庫管理等。在后續的版本中，這些功能將得到很大的擴展，但現有的功能已經非常實用了。
Admin Web Application被定義在自動部署文件：CATALINA_BASE/webapps/admin.xml 。
（譯者注：CATALINA_BASE即tomcat安裝目錄下的server目錄）
你必須編輯這個文件，以確定Context中的docBase參數是絕對路徑。也就是說，CATALINA_BASE/webapps/admin.xml 的路徑是絕對路徑。作為另外一種選擇，你也可以刪除這個自動部署文件，而在server.xml文件中建立一個Admin Web Application的context，效果是一樣的。你不能管理Admin Web Application這個應用，換而言之，除了刪除CATALINA_BASE/webapps/admin.xml ，你可能什么都做不了。
如果你使用UserDatabaseRealm（默認），你將需要添加一個user以及一個role到CATALINA_BASE/conf/tomcat-users.xml 文件中。你編輯這個文件，添加一個名叫“admin”的role 到該文件中，如下：
<role name="admin"/>
你同樣需要有一個用戶，并且這個用戶的角色是“admin”。象存在的用戶那樣，添加一個用戶（改變密碼使其更加安全）：
<user name="admin" password="deep_dark_secret" roles="admin"/>
當你完成這些步驟后，請重新啟動Tomcat，訪問http://localhost:8080/admin，你將看到一個登錄界面。Admin Web Application采用基于容器管理的安全機制，并采用了Jakarta Struts框架。一旦你作為“admin”角色的用戶登錄管理界面，你將能夠使用這個管理界面配置Tomcat。
2．配置應用管理（Manager Web Application）
Manager Web Application讓你通過一個比Admin Web Application更為簡單的用戶界面，執行一些簡單的Web應用任務。
Manager Web Application被被定義在一個自動部署文件中：
CATALINA_BASE/webapps/manager.xml 。
你必須編輯這個文件，以確保context的docBase參數是絕對路徑，也就是說CATALINA_HOME/server/webapps/manager的絕對路徑。
�。ㄗg者注：CATALINA_HOME即tomcat安裝目錄）
如果你使用的是UserDatabaseRealm，那么你需要添加一個角色和一個用戶到CATALINA_BASE/conf/tomcat-users.xml文件中。接下來，編輯這個文件，添加一個名為“manager”的角色到該文件中：
<role name=”manager”>
你同樣需要有一個角色為“manager”的用戶。像已經存在的用戶那樣，添加一個新用戶（改變密碼使其更加安全）：
<user name="manager" password="deep_dark_secret" roles="manager"/>
然后重新啟動Tomcat，訪問http://localhost/manager/list，將看到一個很樸素的文本型管理界面，或者訪問http://localhost/manager/html/list，將看到一個HMTL的管理界面。不管是哪種方式都說明你的Manager Web Application現在已經啟動了。
Manager application讓你可以在沒有系統管理特權的基礎上，安裝新的Web應用，以用于測試。如果我們有一個新的web應用位于/home/user/hello下在，并且想把它安裝到 /hello下，為了測試這個應用，我們可以這么做，在第一個文件框中輸入“/hello”（作為訪問時的path），在第二個文本框中輸入“file:/home/user/hello”（作為Config URL）。
Manager application還允許你停止、重新啟動、移除以及重新部署一個web應用。停止一個應用使其無法被訪問，當有用戶嘗試訪問這個被停止的應用時，將看到一個503的錯誤——“503 - This application is not currently available”。